在未来的某个时代，人类社会已经进入了一个科技高度发达的时代。主角卡勒姆·林奇（Callum Lynch）是一个有着复杂过去的人，他因为家族的秘密而卷入了一场意想不到的冒险之中。卡勒姆通过一种名为“Animus”的高科技设备，体验了自己祖先的记忆。
他的祖先阿圭拉（Aguilar de Nerha）是西班牙兄弟会的一员，在15世纪的西班牙对抗圣殿骑士。在这个过程中，卡勒姆不仅发现了自己与祖先之间的深刻联系，还逐渐了解到刺客组织与圣殿骑士之间千百年来的恩怨纠葛。
随着故事的发展，卡勒姆发现自己不仅仅是在重温历史，更是在为现实中的战斗做准备。他必须利用从祖先那里继承的技能和知识，与现代的刺客组织联手，阻止一场可能毁灭全人类的大灾难。这场灾难由一个神秘的圣殿骑士集团策划，他们试图控制整个人类的历史进程。
影片通过卡勒姆的视角展现了刺客组织的核心理念——自由意志的重要性。同时，也揭示了人性中善与恶的复杂交织。最终，卡勒姆不仅找到了自我救赎的机会，也为这个世界带来了新的希望。
这部电影融合了动作、科幻和历史元素，为观众呈现了一幅波澜壮阔的画面。它不仅仅是一部关于过去的电影，更是对当下以及未来的一次深刻思考。
